MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Zymomonas mobilis subsp. mobilis ATCC 10988 plasmid pZMOB02

Total Repeats: 432

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_017183	AGGGAG	2	12	46	57	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	384410888
2	NC_017183	ACGGC	2	10	97	106	20 %	0 %	40 %	40 %	384410888
3	NC_017183	GCA	2	6	134	139	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384410888
4	NC_017183	GAA	2	6	1041	1046	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384410889
5	NC_017183	TGG	2	6	1048	1053	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	384410889
6	NC_017183	GCG	2	6	1069	1074	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384410889
7	NC_017183	TGG	2	6	1093	1098	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	384410889
8	NC_017183	TCG	2	6	1117	1122	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384410889
9	NC_017183	GC	3	6	1185	1190	0 %	0 %	50 %	50 %	384410889
10	NC_017183	CAG	2	6	1233	1238	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384410889
11	NC_017183	GGCG	2	8	1265	1272	0 %	0 %	75 %	25 %	384410889
12	NC_017183	GCG	2	6	1289	1294	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384410889
13	NC_017183	TCGA	2	8	1321	1328	25 %	25 %	25 %	25 %	384410889
14	NC_017183	CTGA	2	8	1509	1516	25 %	25 %	25 %	25 %	384410889
15	NC_017183	G	6	6	1550	1555	0 %	0 %	100 %	0 %	384410889
16	NC_017183	CGC	2	6	1673	1678	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384410889
17	NC_017183	GAT	2	6	1680	1685	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384410889
18	NC_017183	TCC	2	6	1756	1761	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	384410889
19	NC_017183	GCG	2	6	1806	1811	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384410889
20	NC_017183	AGAC	2	8	1879	1886	50 %	0 %	25 %	25 %	384410889
21	NC_017183	CTAC	2	8	1906	1913	25 %	25 %	0 %	50 %	384410889
22	NC_017183	CG	3	6	2226	2231	0 %	0 %	50 %	50 %	384410889
23	NC_017183	CGA	2	6	2300	2305	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384410889
24	NC_017183	GCT	2	6	4713	4718	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384410890
25	NC_017183	TGA	2	6	4736	4741	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384410890
26	NC_017183	GAA	2	6	4755	4760	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384410890
27	NC_017183	AGG	2	6	4798	4803	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	384410890
28	NC_017183	TC	3	6	4905	4910	0 %	50 %	0 %	50 %	384410890
29	NC_017183	CGATG	2	10	4988	4997	20 %	20 %	40 %	20 %	384410890
30	NC_017183	TGC	2	6	5057	5062	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384410890
31	NC_017183	GAA	2	6	5082	5087	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384410890
32	NC_017183	GC	3	6	5097	5102	0 %	0 %	50 %	50 %	384410890
33	NC_017183	AGA	2	6	5111	5116	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384410890
34	NC_017183	GAG	2	6	5136	5141	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	384410890
35	NC_017183	GCC	2	6	5145	5150	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384410890
36	NC_017183	CAAG	2	8	5197	5204	50 %	0 %	25 %	25 %	384410890
37	NC_017183	GCT	2	6	5250	5255	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384410890
38	NC_017183	TGG	2	6	5260	5265	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	384410890
39	NC_017183	A	6	6	5274	5279	100 %	0 %	0 %	0 %	384410890
40	NC_017183	CGA	2	6	5300	5305	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384410890
41	NC_017183	CTG	2	6	5449	5454	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384410890
42	NC_017183	GTT	2	6	5490	5495	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	384410890
43	NC_017183	CGGAAA	2	12	5505	5516	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	384410890
44	NC_017183	GGT	2	6	5592	5597	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	384410890
45	NC_017183	AG	3	6	5669	5674	50 %	0 %	50 %	0 %	384410890
46	NC_017183	CCG	2	6	5696	5701	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384410890
47	NC_017183	AAC	2	6	5884	5889	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	384410890
48	NC_017183	GTA	2	6	5994	5999	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384410890
49	NC_017183	CAGA	2	8	6021	6028	50 %	0 %	25 %	25 %	384410890
50	NC_017183	CGA	2	6	6040	6045	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384410890
51	NC_017183	TGC	2	6	6173	6178	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384410890
52	NC_017183	TGC	2	6	6182	6187	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384410890
53	NC_017183	GCTGA	2	10	6273	6282	20 %	20 %	40 %	20 %	384410890
54	NC_017183	GAT	2	6	6297	6302	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384410890
55	NC_017183	AGT	2	6	6431	6436	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384410890
56	NC_017183	ACC	2	6	6461	6466	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	384410890
57	NC_017183	GGCA	2	8	6494	6501	25 %	0 %	50 %	25 %	384410890
58	NC_017183	AGC	2	6	6529	6534	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384410890
59	NC_017183	CGA	2	6	6575	6580	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384410890
60	NC_017183	CAGG	2	8	6608	6615	25 %	0 %	50 %	25 %	384410890
61	NC_017183	TTA	2	6	6616	6621	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	384410890
62	NC_017183	GCA	2	6	6659	6664	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384410890
63	NC_017183	TGG	2	6	6727	6732	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	384410890
64	NC_017183	AAG	2	6	6744	6749	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384410890
65	NC_017183	TGA	2	6	6776	6781	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384410890
66	NC_017183	TGC	2	6	6782	6787	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384410890
67	NC_017183	GAA	2	6	6791	6796	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384410890
68	NC_017183	A	6	6	6821	6826	100 %	0 %	0 %	0 %	384410890
69	NC_017183	CGTT	2	8	6834	6841	0 %	50 %	25 %	25 %	384410890
70	NC_017183	GAT	2	6	6965	6970	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384410890
71	NC_017183	AAAT	2	8	6997	7004	75 %	25 %	0 %	0 %	384410890
72	NC_017183	AGG	2	6	7006	7011	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	384410890
73	NC_017183	CGT	3	9	7076	7084	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384410890
74	NC_017183	ATG	2	6	7122	7127	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384410890
75	NC_017183	AGC	2	6	7144	7149	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384410890
76	NC_017183	AAG	2	6	7197	7202	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384410890
77	NC_017183	AAGCA	2	10	7213	7222	60 %	0 %	20 %	20 %	384410890
78	NC_017183	TGC	2	6	7298	7303	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384410890
79	NC_017183	TGA	2	6	7355	7360	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384410890
80	NC_017183	CCA	2	6	7432	7437	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	384410890
81	NC_017183	TGC	2	6	7496	7501	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384410890
82	NC_017183	CGT	2	6	7602	7607	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384410890
83	NC_017183	CGTC	2	8	7642	7649	0 %	25 %	25 %	50 %	384410890
84	NC_017183	TG	3	6	7720	7725	0 %	50 %	50 %	0 %	384410890
85	NC_017183	GACC	2	8	7748	7755	25 %	0 %	25 %	50 %	384410890
86	NC_017183	GGC	2	6	7851	7856	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384410890
87	NC_017183	CGG	2	6	7880	7885	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384410890
88	NC_017183	GAA	2	6	7917	7922	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384410890
89	NC_017183	GAA	2	6	7928	7933	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384410890
90	NC_017183	ACT	2	6	7950	7955	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384410891
91	NC_017183	TCG	2	6	7963	7968	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384410891
92	NC_017183	TGA	2	6	8000	8005	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384410891
93	NC_017183	ACCT	2	8	8040	8047	25 %	25 %	0 %	50 %	384410891
94	NC_017183	GGA	2	6	8066	8071	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	384410891
95	NC_017183	AGG	2	6	8080	8085	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	384410891
96	NC_017183	GCAAA	2	10	8179	8188	60 %	0 %	20 %	20 %	384410891
97	NC_017183	GAA	2	6	8301	8306	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384410891
98	NC_017183	TCG	2	6	8476	8481	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384410891
99	NC_017183	CGA	2	6	8510	8515	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384410891
100	NC_017183	CTTC	2	8	8542	8549	0 %	50 %	0 %	50 %	384410891
101	NC_017183	ATG	2	6	8607	8612	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384410891
102	NC_017183	CTG	3	9	8616	8624	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384410891
103	NC_017183	GGC	2	6	8637	8642	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384410891
104	NC_017183	GAA	2	6	8726	8731	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384410891
105	NC_017183	TCG	2	6	8800	8805	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384410891
106	NC_017183	GC	3	6	8816	8821	0 %	0 %	50 %	50 %	384410891
107	NC_017183	CGG	2	6	8831	8836	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384410891
108	NC_017183	ATA	2	6	8878	8883	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	384410891
109	NC_017183	GCC	3	9	8887	8895	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384410891
110	NC_017183	TTC	2	6	8991	8996	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384410891
111	NC_017183	CCCG	2	8	9079	9086	0 %	0 %	25 %	75 %	384410891
112	NC_017183	GCG	2	6	9152	9157	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384410891
113	NC_017183	A	6	6	9265	9270	100 %	0 %	0 %	0 %	384410891
114	NC_017183	CTGA	2	8	9273	9280	25 %	25 %	25 %	25 %	384410891
115	NC_017183	AGA	2	6	9284	9289	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384410891
116	NC_017183	CGC	2	6	9293	9298	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384410891
117	NC_017183	ATC	2	6	9303	9308	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384410891
118	NC_017183	GCG	2	6	9321	9326	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384410891
119	NC_017183	GCT	2	6	9381	9386	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384410891
120	NC_017183	GGA	2	6	9392	9397	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	384410891
121	NC_017183	GGAT	2	8	9422	9429	25 %	25 %	50 %	0 %	384410892
122	NC_017183	ACA	2	6	9434	9439	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	384410892
123	NC_017183	AG	3	6	9505	9510	50 %	0 %	50 %	0 %	384410892
124	NC_017183	CAT	2	6	9586	9591	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384410892
125	NC_017183	ATTTCT	2	12	9703	9714	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	384410892
126	NC_017183	C	6	6	9805	9810	0 %	0 %	0 %	100 %	384410892
127	NC_017183	AAC	2	6	9819	9824	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	384410892
128	NC_017183	GGA	2	6	9825	9830	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	384410892
129	NC_017183	TCG	2	6	9903	9908	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384410892
130	NC_017183	CCG	2	6	9933	9938	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384410892
131	NC_017183	TGGC	2	8	9993	10000	0 %	25 %	50 %	25 %	384410892
132	NC_017183	CTGCG	2	10	10007	10016	0 %	20 %	40 %	40 %	384410892
133	NC_017183	CGC	2	6	10122	10127	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384410892
134	NC_017183	AC	3	6	10176	10181	50 %	0 %	0 %	50 %	384410892
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139	NC_017183	CGC	2	6	10474	10479	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384410892
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142	NC_017183	CGA	2	6	10573	10578	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384410892
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159	NC_017183	ATT	2	6	12395	12400	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	384410893
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260	NC_017183	TA	3	6	17482	17487	50 %	50 %	0 %	0 %	384410896
261	NC_017183	AACC	2	8	17535	17542	50 %	0 %	0 %	50 %	384410897
262	NC_017183	GCT	2	6	17549	17554	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384410897
263	NC_017183	CGC	2	6	17684	17689	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384410897
264	NC_017183	AAC	2	6	17731	17736	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	384410897
265	NC_017183	AGGC	2	8	17754	17761	25 %	0 %	50 %	25 %	384410897
266	NC_017183	A	7	7	18738	18744	100 %	0 %	0 %	0 %	384410898
267	NC_017183	GATTTT	2	12	18780	18791	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	384410898
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269	NC_017183	TTA	2	6	18877	18882	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	384410898
270	NC_017183	TAA	2	6	18893	18898	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	384410898
271	NC_017183	TTC	2	6	18902	18907	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384410898
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273	NC_017183	GGC	2	6	19064	19069	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384410898
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280	NC_017183	TTC	2	6	19292	19297	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384410898
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282	NC_017183	TA	3	6	19399	19404	50 %	50 %	0 %	0 %	384410898
283	NC_017183	TCT	2	6	19413	19418	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384410898
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291	NC_017183	TAT	2	6	19700	19705	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	384410898
292	NC_017183	TAT	2	6	19742	19747	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	384410898
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295	NC_017183	TTCA	2	8	19780	19787	25 %	50 %	0 %	25 %	384410898
296	NC_017183	CAT	2	6	19799	19804	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384410898
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302	NC_017183	A	8	8	20086	20093	100 %	0 %	0 %	0 %	384410899
303	NC_017183	TGT	2	6	20225	20230	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	384410899
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383	NC_017183	CTGTT	2	10	25881	25890	0 %	60 %	20 %	20 %	384410907
384	NC_017183	TCT	2	6	25944	25949	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384410907
385	NC_017183	GA	3	6	25955	25960	50 %	0 %	50 %	0 %	384410907
386	NC_017183	CTGA	2	8	25995	26002	25 %	25 %	25 %	25 %	384410908
387	NC_017183	GAA	3	9	26028	26036	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384410908
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389	NC_017183	CTT	3	9	26336	26344	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384410909
390	NC_017183	CAT	2	6	26345	26350	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384410909
391	NC_017183	CGT	2	6	26363	26368	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384410909
392	NC_017183	CT	3	6	26427	26432	0 %	50 %	0 %	50 %	384410909
393	NC_017183	T	6	6	26432	26437	0 %	100 %	0 %	0 %	384410909
394	NC_017183	TCT	2	6	26482	26487	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384410909
395	NC_017183	GCT	2	6	26518	26523	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384410909
396	NC_017183	TTC	2	6	26598	26603	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384410909
397	NC_017183	CTC	2	6	26628	26633	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	384410909
398	NC_017183	TGC	2	6	26754	26759	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384410909
399	NC_017183	ACC	2	6	26810	26815	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	384410909
400	NC_017183	ATC	2	6	26817	26822	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384410909
401	NC_017183	CGA	2	6	26901	26906	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384410909
402	NC_017183	CCG	2	6	27030	27035	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384410909
403	NC_017183	GTC	2	6	27292	27297	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384410909
404	NC_017183	TGC	2	6	27302	27307	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384410909
405	NC_017183	CGC	2	6	27382	27387	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384410909
406	NC_017183	CTT	2	6	27411	27416	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384410909
407	NC_017183	GGA	2	6	27473	27478	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	384410909
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410	NC_017183	AAG	2	6	27679	27684	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384410909
411	NC_017183	GCA	2	6	27685	27690	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384410909
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414	NC_017183	ATT	2	6	27809	27814	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	384410909
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416	NC_017183	A	6	6	27832	27837	100 %	0 %	0 %	0 %	384410909
417	NC_017183	AGA	2	6	27849	27854	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384410909
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419	NC_017183	CAT	2	6	27981	27986	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384410909
420	NC_017183	ATG	2	6	28018	28023	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384410909
421	NC_017183	CCT	2	6	28050	28055	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	384410909
422	NC_017183	ATA	2	6	28291	28296	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	384410910
423	NC_017183	AAG	2	6	28318	28323	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384410910
424	NC_017183	GGAT	2	8	28335	28342	25 %	25 %	50 %	0 %	384410910
425	NC_017183	TCA	2	6	28364	28369	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384410910
426	NC_017183	AAGC	2	8	28428	28435	50 %	0 %	25 %	25 %	384410910
427	NC_017183	GATG	2	8	28550	28557	25 %	25 %	50 %	0 %	384410911
428	NC_017183	GAA	2	6	28575	28580	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384410911
429	NC_017183	TA	3	6	28654	28659	50 %	50 %	0 %	0 %	384410911
430	NC_017183	TTG	2	6	28713	28718	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	384410911
431	NC_017183	CTT	2	6	28822	28827	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384410911
432	NC_017183	ATC	2	6	28855	28860	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384410911

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.